Родился 13 февраля 1914 г. в крестьянской семье в селес. Беловая (Белое) Вознесенской вол. Шадринского уезда Пермской губ., ныне деревня Белое входит в Кривской сельсовет Далматовского р-на Курганской обл. После окончания неполной средней школы работал в колхозе, а затем уехал в Свердловск. В 1931 г. по путёвке Свердловского областного комитета ВЛКСМ был направлен на учёбу в г. Пермь, в 3-ю военную школу авиационных техников, после окончания которой работал авиатехником. В 1936 г. окончил Борисоглебскую военную школу лётчиков. С 1936 г. до начала войны служил в Киевской авиационной бригаде. В 1938 г. вступил в ВКП(б). Как один из лучших лётчиков авиабригады выполнял фигуры высшего пилотажа при съёмках советских художественных фильмов «Истребители» (снят в 1939) и «Валерий Чкалов» (снят в 1941). В фильме «Валерий Чкалов» Василий Шишкин вёл свой самолёт И-15 за известного советского лётчика Георгия Байдукова. Воевал с первых дней войны в должности командира эскадрильи 43-го истребительного авиационного полка 16-й авиадивизии. Осенью 1941 г. в бою под Киевом его самолёт был подбит, а сам он ранен в ноги и живот. Приземлился на вражеской территории. Но боевые товарищи не оставили его в беде. Эскадрилья, охраняя его, кружила над местом вынужденной посадки, а командир звена Куприянчик сумел забрать и вывезти своего командира. Отказавшись от госпитализации, Василий Шишкин уже через несколько дней повёл своих товарищей на очередную штурмовку. К 30 января 1942 г. эскадрилья капитана Шишкина уничтожила до 3500 немецких солдат и офицеров, до 300 автомашин с боеприпасами и живой силой противника, 13 батарей полевой и зенитной артиллерии противника, мост через реку Днепр в районе Окуниново, 3 переправы противника через реку Днепр, 3 склада с боеприпасами. В воздушных боях эскадрильей было сбито 10 самолётов противника. Об отличной работе эскадрильи Шишкина в 1941 году были опубликованы статьи во фронтовой газете «Красная Армия». Командир эскадрильи капитан Шишкин лично совершил 126 боевых вылетов, из них 65 — на штурмовку наземных войск противника. 27 марта 1942 г. капитану Шишкину В.И. присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда». В сентябре 1942 г. майор Шишкин был назначен командиром 581-го истребительного авиационного полка (3 февраля 1943 г. преобразован в 55-й гвардейский истребительный авиационный полк), которым командовал до 15 марта 1947 г. 7 ноября 1942 года майору Шишкину был вручён именной самолёт Як-1, построенный на средства колхоза «Сигнал революции» Ворошиловского района (ныне село Усть-Курдюм Саратовского района) Саратовской области. На этом самолёте он летал до конца 1943 г. и сбил 12 вражеских самолётов, участвовал в двух переломных битвах войны — Сталинградской и Курской, воевал на 1-м Белорусском фронте. После Курской битвы полк был перевооружён на самолёты Белл П-39 «Аэрокобра», именной Як-1 был передан в другое подразделение. В конце войны самолёт был отправлен в Саратовский музей и поставлен в сарай, где был разграблен неизвестными. 25 ноября 1955 г. самолёт списали и сняли с учёта фондов музея. Сейчас от самолёта остался киль, который выставлен в экспозиции музея. 55-й ГИАП под командованием гвардии подполковника Шишкина прошёл путь от Сталинграда до Одера, участвовал в Сталинградской, Орловско-Курской, Бобруйской, Ковельско-Люблинской операциях, в боевых действиях 1-го Белорусского фронта. К апрелю 1945 г.гвардии подполковником Шишкиным было произведено 536 боевых вылетов. К 9 мая 1945 г. гвардии подполковник В. И. Шишкин совершил 541 боевой вылет, провёл 156 воздушных боёв, сбил лично 9 и в группе 17 немецких самолётов. После войны продолжил службу в ВВС СССР, освоил реактивные истребители. В 1950 г. окончил Высшие офицерские лётно-технические курсы. В 1956 году в звании полковника вышел в отставку. Жил и работал в городе Киеве Украинской ССР. Умер 22 ноября 1992 г. Похоронен на Берковецком кладбище г. Киева. Награды: Герой Советского Союза, Орден Ленина (27 марта 1942 г.); Медаль «Золотая Звезда» № 842; Орден Ленина (30 декабря 1956 г.); пять Орденов Красного Знамени (9 декабря 1941 г., 9 ноября 1942 г., 30 апреля 1945 г., 19 ноября 1951 г., 4 июня 1955 г.; Орден Суворова III степени (4 июля 1944 г.); Орден Отечественной войны I степени (6 апреля 1985 г.); Орден Красной Звезды (30 апреля 1947 г.); Медаль «За боевые заслуги» (3 ноября 1944 г.); Медаль «За оборону Сталинграда»; Медаль «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941—1945 гг.»; Медаль «За взятие Берлина»; Медаль «За освобождение Варшавы» Именной самолёт Як-1, заводской № 34104 (7 ноября 1942 г.); Военный лётчик 1-го класса (1951 г.)