Родился 8 (20) декабря 1898 года в селе Осиновые Гаи, ныне село Осино-Гай Гавриловского района Тамбовской области. С ноября 1917 года — рядовой 1-го сводного Петроградского отряда Красной Гвардии. В феврале-апреле 1918 года был агитатором-организатором Всероссийской комиссии по организации Рабоче-крестьянской Красной армии. В мае-июле 1918 года — комиссар штаба обороны Поворинского района на Южном фронте; участвовал в боях с Донской армией П.Н. Краснова. В августе-сентябре 1918 года занимал должность военного коменданта Тамбова, в сентябре 1918 года — феврале 1919 года — заведующего отделом вооружения Тамбовского военкомата. В феврале-апреле 1919 года — комиссар пехотных курсов сотенных командиров. В апреле-ноябре 1919 года — курсант-боец 1-х Московских пехотных курсов и 105-го Богучарского полка (Южный и Восточный фронты). Принимал участие в боевых действиях против Чехословацкого корпуса и Добровольческой армии генерала А.И. Деникина. В 1919—1920 — командир 193-го отдельного стрелкового батальона в Москве. В ноябре 1920 года окончил Московскую высшую тактическо-стрелковую школу. В 1920—1923 годы — начальник и комиссар пулемётных курсов Высшей тактическо-стрелковой школы. В 1923 году окончил 2 курса рабфака при Московском высшем техническом училище. В сентябре 1926 года вышел в запас. В июле 1941 года вновь вернулся в армию. В ходе Великой Отечественной войны в июле-декабре 1941 занимал должности начальника строевого отдела, начальника отдела укомплектования 34-й армии. В январе-июне 1942 года — командир 318-го стрелкового полка 241-й стрелковой дивизии. Принимал участие в боевых действиях на Северо-Западном фронте, в обороне Старой Руссы, Демянской операции. В ноябре 1942 года окончил курсы при Академии Генерального штаба имени К. Е. Ворошилова. В ноябре-декабре 1942 года — заместитель командира 172-й стрелковой дивизии, с декабря 1942 года по февраль 1943 года — заместитель командира 232-й стрелковой дивизии. Принимал участие в Воронежско-Касторненской операции на Воронежском фронте. С 5 февраля 1943 года вступил в должность командира 322-й стрелковой дивизии 60-й армии Воронежского фронта 12 февраля 1943 года комдиву 322-й стрелковой дивизии С. Н. Перекальскому посмертно было присвоено звание полковника, а 28 апреля 1943 года Указом Президиума Верховного Совета СССР ему было присвоено звание Героя Советского Союза. С. Н. Перекальский вначале был похоронен в парке по улице Ямская Гора (ныне Детский парк), в 1948 году его прах был перенесён на Никитское кладбище города Курска, а в 1966 году на его могиле установлен мраморный бюст.